MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009051	CCCTG	2	10	430567	430576	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1002	NC_009051	CGG	2	6	431853	431858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_009051	CCG	2	6	435585	435590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_009051	CGGC	2	8	435603	435610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_009051	ATGA	3	12	435619	435630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009051	GGA	2	6	435645	435650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009051	GCC	2	6	436528	436533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_009051	G	6	6	437462	437467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009051	AG	3	6	437531	437536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009051	GA	3	6	439495	439500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009051	CCG	2	6	439512	439517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_009051	GTC	2	6	439529	439534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009051	TGA	2	6	439673	439678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009051	T	6	6	439735	439740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009051	CGCA	2	8	439746	439753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_009051	A	6	6	440568	440573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009051	TA	3	6	441300	441305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009051	GCC	2	6	441321	441326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_009051	G	6	6	441328	441333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009051	AACGG	2	10	441781	441790	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_009051	A	7	7	441830	441836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009051	GCG	2	6	444737	444742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_009051	GCC	2	6	445448	445453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_009051	TAGAA	2	10	445469	445478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009051	GCG	2	6	445506	445511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_009051	GCC	2	6	445533	445538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_009051	CGC	2	6	445541	445546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_009051	TGA	2	6	445568	445573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009051	GGT	2	6	445624	445629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009051	TGC	2	6	445642	445647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_009051	CTT	2	6	445673	445678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009051	TGG	2	6	445682	445687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009051	GCGG	2	8	445750	445757	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_009051	GAG	2	6	445779	445784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009051	TC	4	8	445791	445798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_009051	TC	3	6	445812	445817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_009051	GT	3	6	445831	445836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009051	ACG	2	6	447992	447997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_009051	GCG	2	6	448026	448031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009051	CCT	2	6	448039	448044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_009051	GGGC	2	8	448075	448082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_009051	CGAA	2	8	448203	448210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_009051	AAGG	2	8	448215	448222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009051	ATA	2	6	448303	448308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009051	TCC	2	6	448385	448390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_009051	TGCCG	2	10	448417	448426	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1047	NC_009051	ATT	2	6	448514	448519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_009051	A	6	6	448612	448617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009051	TA	3	6	448658	448663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009051	CCCG	2	8	450488	450495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1051	NC_009051	GTC	2	6	450569	450574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009051	CGT	2	6	451033	451038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_009051	CGG	2	6	452168	452173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_009051	CCG	2	6	453655	453660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_009051	T	6	6	453673	453678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009051	ACC	2	6	455873	455878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_009051	CTG	2	6	455887	455892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_009051	TC	3	6	455921	455926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_009051	CTG	2	6	455967	455972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009051	ACC	2	6	456657	456662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_009051	AT	5	10	457646	457655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009051	TGCGA	2	10	457752	457761	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_009051	TGC	2	6	457762	457767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009051	AT	3	6	457845	457850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009051	GTA	2	6	457865	457870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009051	CAA	2	6	457876	457881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_009051	GCT	2	6	457884	457889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_009051	CCG	2	6	459022	459027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_009051	TAT	3	9	459043	459051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009051	CTT	2	6	459118	459123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_009051	CTT	2	6	459142	459147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009051	CAC	2	6	459195	459200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_009051	GAGAA	2	10	459212	459221	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009051	GC	3	6	459249	459254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_009051	TCGCT	2	10	459948	459957	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1076	NC_009051	CTT	2	6	459965	459970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_009051	CTC	2	6	460022	460027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_009051	AGC	2	6	461831	461836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_009051	GGGT	2	8	463186	463193	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009051	AAT	2	6	464864	464869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009051	GAT	2	6	469372	469377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009051	CCGC	2	8	470632	470639	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1083	NC_009051	CTC	2	6	470648	470653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_009051	GGGC	2	8	470666	470673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_009051	GAA	2	6	470739	470744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009051	GCAGGA	2	12	470774	470785	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1087	NC_009051	CGA	2	6	470806	470811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009051	TTG	2	6	472928	472933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009051	CAA	2	6	472943	472948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_009051	TA	4	8	472966	472973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009051	ATG	2	6	472975	472980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009051	TTC	2	6	474566	474571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_009051	GGC	2	6	474586	474591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009051	CGG	2	6	474621	474626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_009051	CGG	2	6	477028	477033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_009051	CTC	2	6	478660	478665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_009051	CGG	2	6	478673	478678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_009051	CT	3	6	478768	478773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_009051	GGCC	2	8	483025	483032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_009051	GAT	2	6	483058	483063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009051	CT	3	6	483368	483373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_009051	CCT	2	6	483396	483401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_009051	GTG	2	6	483427	483432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009051	CGG	2	6	483443	483448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_009051	GAT	2	6	483506	483511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009051	TG	3	6	483576	483581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009051	GC	3	6	484776	484781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_009051	CGG	2	6	484810	484815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009051	TA	3	6	486454	486459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009051	CAG	2	6	487068	487073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009051	ACTC	2	8	487094	487101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_009051	C	8	8	488664	488671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1113	NC_009051	CAC	2	6	488790	488795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_009051	GAA	2	6	488812	488817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009051	TTC	2	6	488855	488860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_009051	AGG	2	6	488871	488876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009051	GGC	2	6	488913	488918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_009051	GC	3	6	490349	490354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_009051	CA	3	6	491002	491007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_009051	TCT	2	6	493092	493097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_009051	CTC	2	6	493118	493123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_009051	GCA	2	6	493133	493138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009051	CGT	2	6	493174	493179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_009051	CGC	2	6	493184	493189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_009051	GCG	2	6	493200	493205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_009051	GGC	2	6	499044	499049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009051	GAG	2	6	499068	499073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009051	TTC	2	6	499103	499108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009051	GAA	2	6	499367	499372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009051	GCC	2	6	500824	500829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_009051	GAA	2	6	500927	500932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009051	CGC	2	6	502120	502125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_009051	GCAAAC	2	12	502152	502163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_009051	CAG	2	6	502172	502177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_009051	ACA	2	6	502179	502184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_009051	GCCC	2	8	503835	503842	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1413	NC_009051	AGG	2	6	635796	635801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_009051	TGC	2	6	635826	635831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_009051	GAA	2	6	635860	635865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1421	NC_009051	TTCA	2	8	636080	636087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1422	NC_009051	TTCA	2	8	636091	636098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1423	NC_009051	TTCA	2	8	636102	636109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1424	NC_009051	TTCA	2	8	636113	636120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1425	NC_009051	TTCA	2	8	636124	636131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1426	NC_009051	TTCA	2	8	636135	636142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1427	NC_009051	TTCA	2	8	636146	636153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1428	NC_009051	TTCA	2	8	636157	636164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1429	NC_009051	TTCA	2	8	636168	636175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1430	NC_009051	TTCA	2	8	636179	636186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1431	NC_009051	TTCA	2	8	636190	636197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1432	NC_009051	TTCA	2	8	636201	636208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1433	NC_009051	TTCA	2	8	636212	636219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1449	NC_009051	CCGC	2	8	638326	638333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1450	NC_009051	CTC	2	6	638342	638347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1451	NC_009051	C	6	6	638442	638447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1452	NC_009051	GGGC	2	8	638452	638459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1453	NC_009051	GA	3	6	638555	638560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_009051	A	7	7	638587	638593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_009051	TCA	2	6	639556	639561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1456	NC_009051	GTA	2	6	640760	640765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1470	NC_009051	TCC	2	6	646941	646946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1471	NC_009051	GCC	2	6	646963	646968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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